ฟาเบียน บาร์กเตซ เกิดเมื่อวันที่ 28 มิถุนายน ปี 1971 ที่ประเทศฝรั่งเศส
เริ่มต้นเล่นฟุตบอลอาชีพ ในปี 1990 กับตูลูส ทีมในลีกเอิงของฝรั่งเศส ก่อนจะย้ายไปอยู่กับมาร์กเซย์ในปี 1992 และโมนาโก ในปี 1995
เข้าสู่ปี 2000 แมนเชสเตอร์ ยูไนเต็ด หอบเงิน 7.8 ล้านปอนด์ ไปแลกกับ ฟาเบียน บาร์เตซ ที่พึ่งมาทีมชาติฝรั่งเศส คว้าแชมป์โลกในปี 1998 และพาโมนาโก เป็นแชมป์ลีกเอิง 1999/2000 และแน่นอน ดีกรีระดับนี้ ก็ต้องมายึดมือ 1 อย่างไม่ต้องสืบ ฤดูกาล 2000/2001 บาร์เตซ ได้โอกาสลงสนาม 40 นัด รวมทุกรายการ มีส่วนสำคัญในการพาทีม แมนฯยูไนเต็ด คว้าแชมป์พรีเมียร์ลีกมาครอเป็นสมัยที่ 7 ของสโมสร และเป็นแชมป์ลีกสูงสุด สมัยที่ 14 หากรวมดิวิชั่น 1
เข้ามาที่ฤดูกาล 2002/2003 ฟาเบียน บาร์เตซ ยังคงยึดมือ 1 ของทีมเอาไว้อย่างเหนีนวแน่นเขาลงเล่น 46 นัดรวมทุกรายการ แมนฯยูไนเต็ด จบฤดูกาลด้วยการเป็นแชมป์พรีเมียร์ลีก สมัยที่ 8 โดยมีแต้มเหนือ อาเซน่อลรองแชมป์ 5 คะแนน
ภายหลังฤดูกาลนั้น บาร์เตซถูกส่งตัวไปให้มาร์กเซย์ ใช้งานในฤดูกาล 2002/2003 และถูกมาร์กเซย์ซื้อขาดกัลป์คืนไปในฤดูกาล 2003/2004 รวมแล้วบาร์เตซลงสนามให้แมนฯยู 139 นัดรวมทุกรายการ เป็นแชมป์พรีเมียร์ลีก 2 สมัย
บาร์เตซอยู่กับมาร์กเซย์ ถึงฤดูกาล 2005/2006 ก่อนจะย้ายไปอยู่กับน็องต์ ในฤดูกาล 2006/2007 และประกาศเลิกเล่นในปี 2008 ในส่วนของการเล่นทีมชาติ ฟาเบียน บาร์เตซ ติดทีมชาติฝรั่งเศสช่วงปี 1994-2006 ลงเล่นในนามทีมชาติฝรั่งเศส 87 นัด เป็น 1 ในทีมชุดแชมป์โลก ปี 1998 ที่ฝรั่งเศสเป็นเจ้าภาพและแชมป์ยูโร 2000 ที่เอาชนะอิตาลีด้วยโกลเด้นโกล 2-1